至于剩下的张献忠的那些部下，大部分在接到了张献忠的亲笔信之后，都选择了投降刑天军，其中包括艾能奇和刘文秀两人，还有前营将军二虎、右营将军贺国观等人，也都投降了刑天军，只有少数人不愿意投降，但是这些人也成不了什么气候，肖天健暂时也没兴趣去收拾他们了，放在以后，等平定了湖广之后，再收拾他们也不迟。
如此一来，肖天健便以迅雷不及掩耳之势，轻松的将张献忠这个大麻烦给解决掉了，同时还顺手将湖广的西北部包括谷城、保康、南漳、兴山、房山等县，也纳入到了刑天军的辖地之中，下令各部抽调一小批人马去接收这些地盘，负责在这些地盘组建当地的预备营驻守，同时也委任了一批临时性的文吏对这些地方进行管理。
至于张献忠麾下来投的几万人马，肖天健对他们统一进行了甄选，兵油子一概不要，痞兵一概淘汰，以刑天军选兵的标准进行挑选，留下了七千余人，其余的两万多人则都就地遣散，安排他们落地为民，去干回他们的老本行，继续种田去了。
而对于张献忠，肖天健是不会将他和罗汝才相提并论的，表面上对他很是客气，但是却实质上将他软禁了起来，考虑到襄阳一带他的旧部太多，可能会生出事端，所以在整编过他麾下的兵马之后，便将张献忠全家都迁至晋南找地方编管起来，荣华富贵不敢保证他继续过了，起码暂时先保证他全家生命安全，让他们吃饱穿暖即可，对于肖天健这样安排他，张献忠虽然满心不乐意，但是也没敢放个屁，只得老老实实的被一队近卫“护送”着上路，一路上朝着山西行去，如此也彻底切断了他和旧部之间的联系，生的他的旧部再有什么念想了。
当然不得不提一下徐以显和潘独鳌这两个人，肖天健在俘获了张献忠的时候，也同时将他们二人一同俘获，私下里将他们招至了帐中聊了一番，发现这两个人还算是比较有用，要不然的话也不会被张献忠倚重，于是对他们安抚了一番，问他们有什么想法，是去是留。
两个人到了这会儿，也都被刑天军的强大所震慑了，他们这样的文人之所以“从贼”，其实都不是安分之人，就是想在这乱世之中，干点出人头地的事情，眼下他们都是朝廷要抓要杀的人，张献忠已经完了，这不用想了，他们这样的人才不会跟着张献忠一条路走到黑的，同时他们也都发现肖天健其实不是那种心慈手软之辈，比起张献忠来，更有英雄之气，现在让他们自行决定去留，其实就是看他们两个的表现。
去那是胡扯，能去哪儿？这天下现在还能数得着的几路人马，也就仅剩下了李自成一路还算是声望高一点？可是他们两个人辅佐张献忠的时候，都和李自成有过间隙，故此去根本没地方可去，所以两个人也都只能选择留下来，跟着肖天健干，虽说在刑天军之中，他们的地位可能会比跟着张献忠时候要低很多，但是好歹也可以混下去，于是二人都立即跪下向肖天健称罪，表示愿意自此之后追随肖天健。