王士元是否是明朝皇三子又或是明朝皇四子，对于杨延迪和黄进等明军残部来说并不重要，他们只在乎王士元是否是崇祯子嗣？能否继承皇明正统？现在有印信和金册证明王士元的身份，那就足够了。
可是马仲英的内心却掀起了滔天的波澜，因为明史记载就是以王士元冒充明朝五皇子朱慈焕之罪将其全族诛杀，可现在王士元却明明白白地拿出了他是朱慈炤的金册。
历史上张廷玉在朱三太子案结案呈奏中说：“王士元自认崇祯第四子，又查崇祯第四子已于崇祯十四年身故,又遵皇帝圣旨传唤明代老太监，俱不认识。王士元明系假冒，其父子俱应凌迟处死。”
也就是说，伪清朝廷在王士元的身份上说了谎话，以掩盖历史的真相。
康熙要朱慈炤死，但又不能违背他优待前朝宗室的诏命，那编纂明史的主官自然明白怎么操作，那就是用假冒前朝皇子的罪名，这个罪名既能让清廷摆脱严苛无情的骂名,又能让能够影响清廷统治，潜在敌人消弭于无形。
正如孟森所说：“以前朝皇子非罪名，务令以假冒为罪。”因为按真是前朝皇子，那是没罪的，按清廷官方宣称的政策还必须优待朱慈炤，所以一定要说他是假冒前朝皇子，这样才能定罪。
据马仲英估计，清廷在修《明史》的时候，为了掩盖康熙违背自己圣旨，杀害的朱慈炤的事实，在崇祯几个儿子的排序和名字上做了手脚。王士元自供他是崇祯皇帝第四子,《明史》却记载崇祯第四子为朱慈炤，第五子为朱慈焕。因第五子早夭的事实众所周知,清廷就可顺势摆脱杀害朱慈焕的嫌疑，而进一步坐实康熙四十七年凌迟处死的这个“朱慈焕”是个冒牌货，用来混淆视听。
不过马仲英也没有过多纠结此事，因为这不过是满洲篡改明朝历史的冰山一角,现在他要做的就是拨乱反正,不让这段屈辱的历史重演。
“马帅，既然可以确定王士元就是烈皇第四子，马帅何不顺天应人，奉永王为监国，重建我大明国祚，想来天下忠明势力定然会望风景从，如此我皇明复兴有望矣！”
崇祯四皇子的身份在残余的忠明势力中还是很有号召力的，在明确了朱慈炤的身份后，杨延迪和黄进就是不约而同地向马仲英提出了拥立监国的想法。
“本帅奉皇明大旗举义，正是要正本溯源，重铸乾坤，天幸皇四子尚在，正可承继我皇明正统，但如今残存忠明势力中最强者莫过于大员郑家，我等若擅立监国，延平王能同意否？若延平王不愿，岂不又重演当年唐桂之争故事，杨帅和黄副帅本是延平王所属,莫如去信大员，先请示延平王殿下，再做计较。”
如今吴周既灭，云南清军随时可能东奔两广，而两广最强的两股势力就是尚之信的平南军和打着大明旗号的琼州军，此前马仲英向尚之信输诚，打的就是把平南藩挡在前面吸引清军火力，琼州军则利用清军围攻尚之信的机会，在夹缝中发展壮大。